宁静的东北小城澜河，因一桩离奇杀人案掀起波澜。当地著名企业红桥集团发生命案，一夜之间三人被杀，犯罪嫌疑人杨四（胡军 饰）在逃亡途中被抓捕归案，但刑警队长关宇（陈建斌 饰）在审讯途中发现诸多疑点而严红桥原配王萍（邓家佳 饰）似乎与案件存在千丝万缕的联系。随着关宇的调查深入，一段横跨1990年到2005年的东北往事浮出水面。
【洗冤录】是根据一本宋朝（公元1247年）期间所写的书《洗冤录》改编而成，这本法医史上的惊世巨著记载着中国法医学的先驱──宋慈的一生，及怎样抽丝剥茧地破解当时哄动朝野的奇案。宋慈（欧阳震华饰演）诞生于棺材中，被取笑为“棺材仔”，饱受歧视。然而乐观积极的他从不受影响，是一个快乐的打更人。直到他与侠义江湖女唐思（宣萱饰演）被卷进谋杀村长的案件中被判死刑，在案件侦破过程中得到了新知县宋翊的帮助，沉冤得雪之余还被聘请为仵工。其后二人联手，屡破奇案。唐思与捕快聂枫（陈妙瑛饰演同样暗恋宋翊，然而宋翊迎娶的，却是富家千金蓝彩蝶。宋翊的聪明和憨厚慢慢让唐思与聂枫刮目相看，这时却传来了唐思乃是公主的消息，同时，宋翊的行为引起了父母的怀疑，他……不是真的宋翊吗？
何亚春（李影 饰）很早就失去了丈夫，独自将五个子女拉扯大，一家人不知道吃了多少的苦头，受了多少的委屈。拮据的经济迫使何亚春在牌馆出千，被抓后逃亡菲律宾，之后又遭奸人嫁祸，背负上了杀人的罪名锒铛入狱，为了子女，何亚春忍辱负重十八年，终于盼到了出狱的那一天。之后，她回到了香港，和子女团员的日子终于来临。
金阳县山清水秀，物产丰富，但吏治腐败，更因贵族三觉罗的潜心策动，指使地方恶势力为所欲为，横行霸道，令金阳县百姓苦不堪言，国家赋税流失严重。梵如花临危授命，带着小姨子玲珑走马上任，身后还跟着一个"钱庄"派来讨债的伙计簸箩。上任后梵如花先与掌握金阳县经济，并上通大清国各部院的恶势力头面人物"万金刚"交火。通过一番智斗，他以常人所不及的计法，处置了这个通天的大无赖，因而也触犯了大清例律，被罚了两年的俸禄，但却赢得了金阳县百姓的拥戴。金阳县恶势力的幕后老板，自称"小诸葛"的三觉罗，见梵如花来者不善，也一反常态地为百姓做起了善事，但暗中仍在不断地给梵如花设绊儿、下套。簸箩为尽快地了结债务，以种种招数诱梵如花做一回贪官。吕大龙和二姑奶奶都对梵如花赞赏有嘉，暗中相助，却引起了一直暗恋梵如花的小姨子玲珑心中的醋意，故意当着梵如花的面与簸箩亲近。可爱的簸箩不知其"用意"，似箭的心安顿了，说是要陪着玲珑……
《特别使命》是一部描写高智商犯罪的电视剧，该剧有别于其他涉案剧。近年来电视银屏所播出的涉案剧都是以刑事案件为主，例如《重案六组》、《案发现场》等等；然而《特别使命》是围绕“税”这个社会焦点话题来描写的，这无疑是众多涉案影视作品中的一个新的亮点。
该剧讲述情绪失联总裁摊上“神共情”格斗保镖少女的甜蜜故事。
