《奈克瑟斯奥特曼EX：诗织 - 失落的记忆 -》是《奈克瑟斯奥特曼》特别篇，由北浦嗣巳导演、赤星政尚编剧。另外，本集未曾在电视插放，只在DVD版发行。

这是一个热得不能再热的夏天。科幻协会的7位好朋友：河本（瑛太饰）、曾我（与座嘉秋饰）、遙（上野樹里饰）等人逗留在学校里玩耍。某日，他们在房间的一角突然发现了一个凭空冒出的时光机！　　心绪激荡的众人开始讨论起他们的时光之旅，他们一致决定要回到昨天拿回不小心弄坏的空调遥控器——这天气，没空调可不好活啊。　　穿越时空的人并不是游刃有余的，肆意更改过去可能会引起不良后果，“严重的话，一切都会消失。”研究员穗积（佐々木蔵之介饰）下出如此判断。大家开始恐慌起来，为了一个小小的遥控器，他们竟会因此消失吗？

一场车祸夺走了岩本聪母亲的生命，岩本聪（本乡奏多 饰）也因此致残，活在自闭的小世界里，连上学都成为了负担。父亲痛爱儿子，研制出机械人H603给他作伴。岩本聪干脆远程遥控这个机械人，让他替代自己上学。
　　H603来到学校，对周围的事物感到好奇，同学们都叫他“丝柏人”。岩本聪用电脑技术，配合在丝柏人身上应付各种现实生活中的际遇。 丝柏人认识了纯（多部未华子 饰）——一个霸道帅气的女生，岩本聪通过丝柏人同纯开始了默契的交流。但是，一个可怕的流言摧毁了岩本聪、丝柏人和纯之间的关系。丝柏人能否脱离险境，岩本聪能否获得心灵的救赎，走出心理阴影，事情充满变数……