本剧剧情是以“日本首位女性法官及女性律师之一”的三渊嘉子为蓝本，故事背景设定在昭和时期，主角考取明治大学新设女子专科法律系，而后考上司法部高等公务员考试，成为日本多位考上律师的女性文官之一，进入法院工作后遇上二战爆发，之后为了帮助战后遇到困难的难民，她向法务部提交担任法官的申请，但法务部驳回她的申请，于是她随即参与了日本民法的修法和司法部家事法院的设立，在昭和24年法务部点头准许后，成为日本首位女性法官。
年轻的南希·德鲁 (Nancy Drew) 计划在高中毕业后离开家乡上大学，但发现自己陷入了一个超自然的谋杀之谜。
君武大陆昔日的天才少女凤舞惨遭宿敌左青鸾暗算，丢失凤凰真血成为废人，师父牧九州为救凤舞耗尽元气陷入沉睡。与此同时，现代宅女、中医专业大学生孟媛因游戏意外进入这个修仙世界成为了废柴凤舞，并与君武一族圣子君临渊有着似有似无的婚约。在以凤舞身份生活修练的日子里，孟媛用自己的现代思维与中医知识保护着异世界的家人，结交了并肩作战的伙伴，也与君临渊相知相恋，开启了她甜爽交织，与君临渊相互扶持的第二人生。
忍不住查看男友手机的初见（黄翠茹 饰）意外的发现了男友和其他女孩的暧昧讯息，感情受到伤害的初见黯然神伤，再也无法面对男友一如既往的甜言蜜语。天送（黄浩然 饰）的姐姐和姐夫死于一场火灾，心中充满了对于姐姐的愧疚，天送毅然放弃了自己成为玻璃艺术家的梦想，收养了姐姐的女儿悠悠（杨铠凝 饰），没想到他对悠悠的无微不至在无形之中给予了恋人蔡妍（姚子羚 饰）巨大的心理压力，如积月累之间，两人渐行渐远。
1936年上海，从小被人收养的徐继发是一名警探，并受命调查一桩坠楼案，在他追查遭到陷害面临绝境之时，竟遇到了失散多年的亲母和胞弟，了解到自己的身世牵扯着15年前的黄金劫案，元凶与坠楼案的真凶竟是同一伙人，胞弟林奕晨竟也被他们误认作徐继发杀害。为了破案复仇，徐继发伪装成弟弟的身份继续追查真相.历尽艰辛，徐继发终于将罪犯全部绳之于法。在追查真相的过程中徐继发目睹了国民政府的腐朽和黑暗，同时让他感到发生在自己身上的悲剧是因为整个社会的腐败，他开始接触到新的思潮，从只注重个人恩怨发展到关心民族前程，抗日战争爆发后，徐继发毅然走上了寻找光明的道路。
《特别使命》是一部描写高智商犯罪的电视剧，该剧有别于其他涉案剧。近年来电视银屏所播出的涉案剧都是以刑事案件为主，例如《重案六组》、《案发现场》等等；然而《特别使命》是围绕“税”这个社会焦点话题来描写的，这无疑是众多涉案影视作品中的一个新的亮点。
