故事发生在大唐宪宗的永贞元年,朝中阉宦势力,特别是权倾朝野的俱公公,横行无忌,令人发指。木相国的女儿木芙蓉因继母秦氏的逼婚与压迫而倍感绝望。在一次绝境中,她决定跳下绣楼寻求解脱,千钧一发之际,她被夜行侠所救。夜行侠是个专门惩治贪官污吏的义士,隐藏着复仇的目的。他与木芙蓉之间迅速产生了深厚的情感,但俱公公察觉到他们的关系,开始对木芙蓉施加压力,逼迫她与秦阙成婚。为了保护木芙蓉,夜行侠冒险出手相救,但在与俱公公的势力对抗中身受重伤。
袁旭与童昕是《第三视角》栏目新闻调查组的记者,二人发现某集团价值几十亿的商业机密遭窃,便假扮成疑犯陈雪琴的接头人,帮警察成功破案。袁旭回到家,却发现房中一片混乱,童昕晕倒在地,袁旭识破了童昕的诡计,便回到沙发上专心看起了球赛。袁旭、童昕采访至酷科技网络公司的总裁吴磊,不料却传出对方儿子吴昊遭绑架的消息,新闻媒体也在第一时间报道了该事件。
锦绣,河山原本两个不可能再相见的初恋情人,却因为张锦绣回乡探望病重母亲,再次交集了。张锦绣怕子欲养而亲不待,更被黄河山对家乡的责任所感动,果断做出了留乡创业的决定。家人的反对,视她为情敌的郝美丽暗中捣乱,村长妹夫的讨好利用,与黄河山的误会也层出不断。但张锦绣坚信,不忘初心,方得始终。随着张锦绣的清洁能源产业在村里不断壮大,两人却发现物质生活提高了的村民,却存在着赌博、物质攀比等陋习,这让他们看着扎心。于是两人冰释前嫌,在村里共同创办农家书屋,环湖比赛等。让村民的生活,更加丰富精彩,自信。张锦绣的母亲也因为有了女儿的陪伴,原本还有两个月的生命,却延续了几年安详幸福地走了。丈夫倪洪涛也理解了张锦绣的付出,愿意定居在这看得见山望得见水的乡村。
《特别使命》是一部描写高智商犯罪的电视剧,该剧有别于其他涉案剧。近年来电视银屏所播出的涉案剧都是以刑事案件为主,例如《重案六组》、《案发现场》等等;然而《特别使命》是围绕“税”这个社会焦点话题来描写的,这无疑是众多涉案影视作品中的一个新的亮点。